Zespół drażliwego jelita bardzo często jest stanem który poprzedza chorobę która nazywa się wrzodziejące zapalenie jelita grubego i w szczególności dotyczy to końcowego odcinka jelita grubego w którym dochodzi do tworzenia się ropni oraz przetok. Dlatego w żaden sposób nie można lekceważyć choroby i wykonać trzeba prawidłową diagnostykę ,tutaj jednak pojawiają się pewne komplikacje ponieważ zespół jelita drażliwego choroba leśniowskiego-crohna oraz wrzodziejące zapalenie jelita grubego dają bardzo podobne objawy, dlatego rozstrzygająca w tym przypadku jest kolonoskopia oraz pobranie wycinka do badania patomorfologicznego.
Testy na nietolerancje pokarmowe mają się nijak do zespołu jelita drażliwego ponieważ na dzień dzisiejszy nie ma żadnych poważnych badań które udowodniły by, że jednostka chorobowa związane z jakąkolwiek reakcją alergiczną substancje zawarte w pokarmach.